丽江市交通运输局是丽江市人民政府直属正处级工作部门，加挂丽江市地方民航发展局、丽江市地方铁路发展局牌子，负责统筹全市综合交通运输体系建设，规划公路、铁路、民航、水路等行业发展，并承担综合运输市场监管、安全生产及应急管理等职责，2020年获评“云南省抗击新冠肺炎疫情先进集体” 。下设13个内设科室，局属事业单位包括丽江市交通运输综合行政执法支队、丽江市公路工程质量监督站、丽江市地方公路管理处、丽江市交通运输工程造价管理处等 。主要领导包括局长木仕斌（2025年任命）及分管民航、邮政等领域的副局长 。
该局近年来推进交通运输综合行政执法改革，成立县（区）执法大队并开展专项培训 ，与中国船级社重庆分社签署联合船舶检验协议并授牌联合船舶检验工作站 ，主导建立联合船舶检验工作站以强化水上安全监管 。同时负责协调铁路、民航等垂直管理部门，指导国际航线开发，监督交通基础设施建设及运输市场规范 ，2024年新开通至越南胡志明市的航线 。在政务公开方面，定期更新机构职能、审批事项及财政信息，优化行政审批流程，2025年公示新增包车客运运力申请及涉旅典型行政处罚案件 。2023年推进玉峰寺路提质升级改造工程，该路段被评为云南省绿美农村公路示范工程 。
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