中国科学院东北地理与农业生态研究所成立于2002年，由中国科学院长春地理研究所与黑龙江农业现代化研究所合并组建，主管部门为中国科学院，总部位于长春市。 。该所聚焦农业生态、湿地生态、遥感与地理信息系统、环境科学与技术、区域发展等研究领域，设有4个研究中心、6个省部级重点实验室以及黑龙江三江平原沼泽湿地生态系统国家野外科学观测研究站等5个野外台站 。截至2018年，全所在岗职工313人，含中国工程院院士刘兴土及国家杰出青年科学基金获得者宋长春等科研人员；根据2015年统计，研究所在学研究生196人（其中硕士生81人、博士生115人），在站博士后24人 。
研究所研发的多频段微波辐射计相关技术取得国家科技进步奖，农作物高光效种植模式使东北地区作物单产显著提升，苏打盐碱地治理技术实现重度盐碱地水稻亩产显著改善 。主办的《地理科学》为国内地理学核心期刊，《中国地理科学》（英文版）被SCI-E收录，《湿地科学》为中国首份湿地专业学术期刊 。与德国马普学会化学研究所、俄罗斯太平洋地理研究所等机构建立长期合作 ，吉林大安农田生态系统国家野外观测研究站于2021年获“全国工人先锋号”称号 。该所参与“黑土粮仓”科技会战专项行动，研发的盐碱地治理“大安模式”推广面积达700余万亩 。
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